Si cualquiera de los factores faltara, o si no funcionara adecuadamente, la reacción en cadena se interrumpe. Cuando esto ocurre, el coágulo sanguíneo no se forma y el sangrado continúa durante más tiempo del que debería.
Las deficiencias de factor VIII y factor IX se conocen como hemofilia A y B, respectivamente. Las deficiencias de factor poco comunes son trastornos de la coagulación en los que falta o no funciona adecuadamente alguno de los otros factores de coagulación (i. e. factores I, II, V, VII, X, XI, o XIII). El conocimiento sobre estos trastornos es menor porque se diagnostican muy raramente. De hecho, muchos de ellos solo han sido descubiertos durante los últimos 40 años.
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